Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ACACAQ13085 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ACACAQ13085 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms