Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms