Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms