Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WASHC2CQ9Y4E1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WASHC2CQ9Y4E1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WASHC2CQ9Y4E1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
WASHC2CQ9Y4E1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WASHC2CQ9Y4E1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WASHC2CQ9Y4E1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms