Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
INO80Q9ULG1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INO80Q9ULG1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms