Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms