Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smad9Q9JIW5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms