Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx12Q9ER00 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms