Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TcimQ9D915 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms