Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Derl3Q9D8K3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Derl3Q9D8K3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Derl3Q9D8K3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Derl3Q9D8K3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms