Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrps9Q9D7N3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms