Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms