Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Khdc3Q9CWU5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms