Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Nsmce3Q9CPR8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Nsmce3Q9CPR8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Nsmce3Q9CPR8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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