Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms