Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC17Q96LX7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms