Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms