Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms