Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl16Q8BSU2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms