Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ckap4Q8BMK4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ckap4Q8BMK4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms