Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tarsl2Q8BLY2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tarsl2Q8BLY2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tarsl2Q8BLY2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tarsl2Q8BLY2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tarsl2Q8BLY2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tarsl2Q8BLY2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms