Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf4Q8BH24 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf4Q8BH24 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms