Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab1Q8BG18 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms