Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snd1Q78PY7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snd1Q78PY7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms