Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Igsf3Q6ZQA6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms