Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms