Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc5a6Q5U4D8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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