Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Specc1Q5SXY1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms