Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm906Q3V0M1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm906Q3V0M1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms