Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cog7Q3UM29 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cog7Q3UM29 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms