Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Treml4Q3LRV9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Treml4Q3LRV9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms