Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TNIP1Q15025 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNIP1Q15025 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms