Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc4Q08624 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms