Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms