Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RykQ01887 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RykQ01887 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RykQ01887 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RykQ01887 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RykQ01887 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RykQ01887 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RykQ01887 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms