Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apoa1Q00623 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms