Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arf1P84078 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Arf1P84078 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Arf1P84078 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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