Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nucb2P81117 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms