Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms