Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn18P56857 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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