Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms