Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rph3aP47708 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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