Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms