Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TfamP40630 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TfamP40630 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TfamP40630 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TfamP40630 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms