Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChgaP26339 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms