Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr3aP23979 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms