Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcaP20444 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms