Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18529 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P18529 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18529 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18529 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18529 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
P18529 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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