Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254cP0DN91 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254cP0DN91 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Tmem254cP0DN91 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms