Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmem254bP0DN90 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tmem254bP0DN90 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem254bP0DN90 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms